Nació en Ciempozuelos, España, el 16 de diciembre de 1906. Realizó sus estudios profesionales en Ciencias Naturales en la Universidad Complutense de Madrid y se inició en la investigación científica en el Laboratorio de Fisiología de la Junta para la Ampliación de Estudios (JAE). Fue discípulo del doctor Juan Negrín, reconocido fisiólogo español, quien a su vez había sido discípulo del Premio Nóbel en Medicina, el doctor Santiago Ramón y Cajal. Al concluir sus estudios universitarios, fue becado por la JAE para realizar estudios en la Universidad de Viena y posteriormente, en la Universidad de Berlín. Al terminar la guerra civil en España, llegó a México en 1939 como exiliado republicano, ingresó al Instituto Politécnico Nacional en 1940, y adquirió la nacionalidad mexicana en 1942.
Por su preparación en las ciencias fisiológicas participó en la creación del Instituto Mexicano de Farmacología y Farmacodinamía en colaboración con otros científicos mexicanos, entre ellos, el reconocido fisiólogo José Joaquín Izquierdo. En 1940 creó el Laboratorio de Fisiología General y Vegetal de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB) del IPN, que en poco tiempo ganó prestigio por la calidad de los trabajos que ahí se realizaban. Participó en la creación del doctorado en Bioquímica y de la carrera de Ingeniero Bioquímico (ENCB). Una parte importante de su vida productiva la dedicó a la creación del Centro de Desarrollo de Productos Bióticos (CeProBi), donde se desempeñó como director adjunto (1982-1992).
Algunas de las distinciones a las que se hizo merecedor fueron:
El doctor Manuel Castañeda Agulló falleció en la Ciudad de México el 10 de enero de 2001.
Roberto Briones Martínez.
Maestro Decano del CEPROBI.