La Maestría en Ciencias en Manejo Agroecológico de Plagas y Enfermedades tiene como propósito formar recursos humanos con conocimientos, habilidades y actitudes que les permiten realizar investigación sobre problemas fitosanitarios y ofrecer alternativas de manejo ambientalmente racionales y sostenibles. Cumple de esta manera con la misión Politécnica de formar recursos humanos a nivel de posgrado que realicen investigación con capacidad de transferir sus resultados al sector agrícola. El ingreso es en agosto de cada año y el aspirante debe cubrir los requisitos establecidos. El proceso de admisión se realiza dos meses antes del inicio de clases. La recepción de documentos es todo el año.
El programa de estudios es flexible, permitiendo que se planee y organice el programa para cada estudiante, de acuerdo a su formación académica previa y a la línea de investigación a la que se vinculará su trabajo de tesis.
Cuenta con registro en el Programa Nacional de Posgrado (PNPC) del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), por lo que los alumnos pueden acceder a becas.
Los aspirantes deberán contar con el grado de licenciatura en el área de las Ciencias Químico-Biológicas ó Agrícolas y tener interés en la investigación científica y tecnológica en el área de manejo de plagas y enfermedades agrícolas. Deberán de mostrar conocimientos básicos de biología y ciencias agrícolas, y las capacidades verbal y cuantitativa que corresponden a los egresados de licenciatura. Deberán mostrar disposición para realizar actividades de investigación de laboratorio y campo, así como para el trabajo colaborativo multidisciplinario. Sus valores deberán ser acordes a los del Instituto Politécnico Nacional y los de la sociedad en general. Además deberán probar su capacidad para la lectura y comprensión de textos en inglés.
El egresado del programa contará con los conocimientos y habilidades que le permitirán realizar el diagnóstico de problemas fitosanitarios, proponer la forma más adecuada de manejo según cada caso y realizar investigación acerca de alternativas ambientalmente racionales para el manejo de plagas y enfermedades de plantas, basado en los principios de la agroecología y el desarrollo sostenible. Asimismo, conocerá y aplicará las tecnologías de información para mantenerse actualizado en el área de su especialización y estará capacitado para comunicar y difundir los resultados de su trabajo.